Les funcions del rector són:
- a) Ser el representant institucional de la Universitat d’Andorra.
- b) Presidir el Consell Universitari i la Junta Acadèmica de la Universitat.
- c) Exercir, d’acord amb les línies estratègiques establertes pel Consell Universitari, la direcció de l’activitat acadèmica i administrativa general i la coordinació dels centres.
- d) Dirigir la millora de la qualitat de la institució.
- e) El rector pot delegar en els directors de centre i en el vicerector l’exercici de les seves competències per un temps determinat.