Les funcions de la Comissió d’apel·lacions són:
a. Resoldre els recursos administratius interposats contra les resolucions de la Comissió d’Avaluacions o contra altres resolucions emeses per l’AQUA.
b. Emetre informes de revisió dels recursos administratius interposats contra les resolucions de la Comissió d’Avaluacions o contra altres resolucions emeses per l’AQUA.
c. Altres funcions que li siguin encarregades pel Comitè Director.